Cet article rend compte de la composition du peuplement ichtyologique du bassin de l'Yonne, affluent le plus important de la Seine. Les captures de 58 échantillons ponctuels sont analysées. Sur le cours principal, les associations ichtyologiques sont conformes avec les zonations longitudinales bien connues (HUET, 1949 ; VERNEAUX, 1973), montrant une augmentation progressive de la richesse spécifique de l'amont vers l'aval. Le schéma général est confirmé à l'échelle du bassin tout entier, comme cela apparaît dans l'analyse des correspondances entre stations et compositions faunistiques. La distribution des poissons est en relation avec les paramètres morphométriques tels que l'altitude, la distance à la source et le rang fluvial. Néanmoins, des altérations apparaissent dans les parties amont des cours d'eau dues à la présence d'espèces d'eau calme en provenance des multiples étangs construits ces dernières années. Malgré une bonne qualité chimique d'eau, la chenalisation dans les zones inférieures conduit à une homogénéisation du courant et une réduction des zones d'eau courante. Ceci se traduit par une réduction de la richesse spécifique avec une disparition marquée des espèces rhéophiles. 31 espèces ont été capturées, et la confrontation avec des données anciennes montre que presque toutes les espèces migratrices (excepté l'anguille) ont disparu, principalement du fait de la construction des barrages pour la navigation. 5 nouvelles espèces sont dues aux introductions. The présent paper deals with the fish composition of the Yonne River basin, one of the most important tributary of the Seine River. Catches from a total of 58 sampling points are analysed. On the main river, fish assemblages are consistent with the well-known longitudinal zonations (HUET, 1949 ; VERNEAUX, 1973), showing a progressive increase of the spécifie richness from up to downstream. This gênerai scheme is confirmed at the watershed level as described by the correspondence analysis of the stations by fauna matrix. The fish distribution is related to morphometric parameters like élévation, distance from the source and stream order. Nevertheless, disturbances appear in the upper streams, due to the présence of limnetic species escaped from the multiple new-built fish ponds. While, despite a good Chemical water quality, the chenalization in the lower parts leads to a homogenization of the flow and a réduction of the lotie habitats. This results in a decrease of the species richness with a markedly disappearance of the rheophilic species. 31 species were caught, and by comparison with old data, almost ail the migratory species (except anguilla) have disappeared, mainly due to the dams built for the navigation. On the contrary, 5 new species resuit from introduction