Minipreparation of total cellular DNA is useful as an alternative molecular marker of mitochondrial DNA for the identification of Trichophyton mentagrophytes and T. rubrum

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Abstract
Summary. Total cellular DNA was extracted from 18 isolates of Trichophyton mentagrophytes and six isolates of unidentified Trichophyton species taken from tinea corporis, tinea cruris and tinea pedis patients by a minipreparation method. The DNA was digested with the restriction enzymes HaeIII and MspI, followed by electrophoresis on agarose gels. The restriction enzyme profiles of the DNAs were compared with those of mitochondrial (mt) DNA extracted from reference strains of T. mentagrophytes (Arthroderma simii, A. benhamiae and A. vanbreuseghemii) and T. rubrum. All 18 T. mentagrophytes isolates showed the same DNA profiles as mtDNA from A. vanbreuseghemii. The six unidentified Trichophyton isolates exhibited DNA profiles the same as that of mtDNA from T. rubrum. Consequently, these isolates were identified as T. rubrum. In conclusion, restriction enzyme analysis of total cellular DNA prepared by the minipreparation method is considered to be useful as an alternative method of mtDNA analysis and is helpful for the identification of these dermatophyte species.Zusammenfassung. Von 18 Trichophyton mentagrophytes‐Stämmen und von sechs nicht‐identifizierten Trichophyton‐Stämmen, sämtlich Isolate von Patienten mit Tinea corporis, Tinea cruris und Tinea pedis, wurde mittels einer Minipraparationsmethode die Gesamtzell‐DNA extrahiert. Diese DNA‐Proben wurden mit den Restriktion‐senzymen HaeIII und MspI angedaut und mittels Agarosegel‐Elektrophorese fraktioniert. Die Restriktionsenzym‐Profile dieser DNA‐Proben wurden mit denen mitochondrialer DNA (mtDNA) verglichen, die von Referenzstämmen von Trichophyton mentagrophytes (Arthroderma simii, A. benhamiae und A. vanbreuseghemii) und von T. rubrum gewonnen worden waren. Alle 18 T. mentagrophytes‐Isolate zeigten DNA‐Profile wie das der mtDNA von A. vanbreuseghemii. Die DNA‐Profile der sechs nicht‐identifizierten Trichophyton‐Stämme waren gleich dem der mtDNA von T. rubrum und wurden somit als T. rubrum identifiziert. Die Restriktionsenzym‐Analyse von Gesamtzell‐DNA als Minipräparation wird daher als brauchbare alternative Methode zur mtDNA‐Analyse angesehen und dürfte für die Identifizierung dieser Dermatophyten‐Arten hilfreich sein.