A note on the use of DNA fingerprints to assess the coefficient of inbreeding in populations with unknown pedigree
- 12 January 1993
- journal article
- Published by Wiley in Journal of Animal Breeding and Genetics
- Vol. 110 (1-6) , 156-160
- https://doi.org/10.1111/j.1439-0388.1993.tb00727.x
Abstract
The relationship between the inbreeding coefficient and characteristics of DNA fingerprints is described to show opportunities of using DNA fingerprinting in assessing the inbreeding coefficient in populations with unknown pedigree. Characteristics studied include the number of bands per individual and the average level of bandsharing among individuals in a population. Conceptually simple functions relating allelic frequencies, inbreeding coefficient, and DNA fingerprint characteristics are derived. An increase in the inbreeding coefficient, with constant allelic frequencies, decreases both the number of bands and bandsharing. Allelic fixation will give rise to low numbers of bands but also to higher levels of bandsharing. It is concluded, that when empirically positive correlations between bandsharing and inbreeding are found, this should be due to drift and family structure in small populations subjected to drift and not to the effect of inbreeding per se. ZUSAMMENFASSUNG: Verwendung von DNA-Fingerprints zur Inzuchtschätzung in Populationen ohne Herdbuchaufzeichnungen Der Zusammenhang zwischen Inzuchtkoeffizienten und DNA-Fingerprints ist in Hinblick auf Nutzung von DNA-Fingerprints zur Ermittlung der Inzuchtkoeffizienten in Populationen mit unbekannter Abstammung dargestellt worden. Bei DNA-Fingerprints sind Anzahl der Bande eines Individuums und das durchschnittliche Niveau der Bandengleichheit zwischen Individuen meßbar. Zwischen Frequenz von Genen, Inzuchtkoeffizienten und Eigenschaften von DNA Fingerprints existiert ein relativ einfacher Zusammenhang. Eine Zunahme des Inzuchtkoeffizienten bei gleichbleibender Frequenz der Gene ergibt eine Abnahme der Bandenzahl je Individuum und der Bandengleichheit. Genfixierung ergibt niedrigere Anzahl von Banden, aber auch höhere Bandengleichheit. Zusammenfassend, ein empirisch positiver Zusammenhang zwischen Bandengleichheit und Inzuchtkoeffizient kann infolge Zufallsdrift und Verwandtschaft von Individuen in kleinen Populationen auftreten und nicht unbedingt infolge Inzucht an sich.Keywords
This publication has 10 references indexed in Scilit:
- No Excess of Homozygosity at Loci Used for DNA FingerprintingScience, 1990
- The similarity index and DNA fingerprinting.Molecular Biology and Evolution, 1990
- Assessment of inbreeding by DNA fingerprinting: development of a calibration curve using defined strains of chickens.Genetics, 1990
- Variable Number of Tandem Repeat (VNTR) Markers for Human Gene MappingScience, 1987
- Hypervariable ‘minisatellite’ regions in human DNANature, 1985
- DEVIATIONS FROM HARDY-WEINBERG PROPORTIONS: SAMPLING VARIANCES AND USE IN ESTIMATION OF INBREEDING COEFFICIENTSGenetics, 1984
- ESTIMATES OF INBREEDING IN A NATURAL POPULATION: A COMPARISON OF SAMPLING PROPERTIESGenetics, 1982
- Immunogenetic and population genetic analyses of Iberian cattleAnimal Blood Groups and Biochemical Genetics, 1980