Phylogenetic analysis of 8 dermatophyte species using chitin synthase 1 gene sequences

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Abstract
Summary. Nucleotide sequences of chitin synthase 1 (CHS1) gene of eight species of dermatophytes, Arthroderma benhamiae, A. fulvum, A. grubyi, A. gypseum, A, incurvatum, A. otae, A. simii and A. vanbreuseghemii were obtained and analysed for their phylogenetic relationship. A 600‐bp genomic DNA fragment of the CHS1 gene was amplified from these dermatophytes by polymerase chain reaction (PCR) and sequenced. The CHS1 nucleotide sequences of these eight dermatophyte species showed more than 85% similarity between the species. The phylogenetic analysis of their sequences revealed three clusters, the first cluster consisting of A. benhamiae, A. simii and A. vanbreuseghemii, the second cluster consisting of A. fulvum, A. gypseum and A. incurvatum, and the third cluster consisting of A. grubyi and A. otae. The phylogenetic analysis of CHS1 gene in this study will provide useful information for classification and understanding the evolution of these dermatophyte species. Zusammenfassung. Es wurden die Nukleotidsequenzen des Chitinsynthase‐1‐Gens (CHS1) von 8 Dermatophytenarten gewonnen und auf ihre phylogenetische Verwandschaft analysiert, nämlich von Arthroderma benhamiae, A. fulvum, A. grubyi, A. gypseum, A. incurvatum, A. otae, A. simii und A. vanbreuseghemii. Ein 600‐bp‐Genom‐DNA‐Fragment des CHS1‐Gens dieser Dermatophyten wurde mittels PCR amplifiziert und sequenziert. Die CHS1‐Nukleotidsequenzen dieser 8 Dermatophyten‐Arten zeigten mehr als 85% Homologie zwischen den Arten. Die phylogenetische Analyse dieser Sequenzen ergab 3 Cluster, der erste Cluster bestehend aus A. benhamiae, A. simii und A. vanbreuseghemii, ein zweiter bestehend aus A. fulvum, A. gypseum und A. incurvatum, und ein dritter bestehend aus A. grubyi und A. otce. Die phylogenetische Analyse des CHS1‐Gens erbringt weiterführende Informationen für die Klassifikation und das Evolutionsverstandnis dieser Dermatophytenarten.